64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2174 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2174  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  156  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  76.19 
 
 
293 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  73.81 
 
 
325 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  73.81 
 
 
325 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  69.05 
 
 
319 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  73.81 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  71.43 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  69.05 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  69.05 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  69.05 
 
 
326 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  66.67 
 
 
329 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  69.05 
 
 
325 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  64.29 
 
 
198 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  64.29 
 
 
198 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  64.29 
 
 
316 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  61.9 
 
 
325 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  61.9 
 
 
325 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  61.9 
 
 
325 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  61.9 
 
 
325 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  76.47 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  61.9 
 
 
325 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  57.14 
 
 
198 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  59.52 
 
 
323 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  57.14 
 
 
325 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  57.14 
 
 
325 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  57.14 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  52.38 
 
 
326 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  52.38 
 
 
326 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  48.94 
 
 
326 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  55.32 
 
 
326 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  55.32 
 
 
326 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  52.38 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  45.16 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  47.92 
 
 
326 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  47.62 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  47.62 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  45.24 
 
 
325 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  47.62 
 
 
325 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2256  hypothetical protein  74.07 
 
 
37 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  45.24 
 
 
325 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  40.91 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  58.62 
 
 
323 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  70.37 
 
 
49 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  59.26 
 
 
370 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>