264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0051 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0051  putative flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
127 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.61 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.61 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1648  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.58 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  32.85 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.85 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.25 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.33 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.66 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.25 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2349  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.34 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  35.25 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  34.31 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  32 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2993  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.43 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  31.34 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  33.58 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  30.6 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.03 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.77 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  28.77 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  30.88 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  31.11 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  30.88 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  32.37 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  30.88 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.94 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  34.01 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  30.88 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.82 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.94 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  31.85 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  31.85 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  31.91 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.33 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.39 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.33 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.78 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  31.62 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  30.15 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.33 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.85 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0980  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.33 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.442663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.43 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.85 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.85 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.86 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2269  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.25 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  29.71 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  29.5 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.62 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.56 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  32 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.47 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.88 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.66 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.08 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.33 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.66 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31240  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.6 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.652275  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  28.78 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2029  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  31.88 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  29.08 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  31.58 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  29.79 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  29.08 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.29 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.82 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  27.41 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>