256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2349 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2349  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0980  protein of unknown function DUF1078 domain protein  67.41 
 
 		 134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.442663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1648  protein of unknown function DUF1078 domain protein  59.54 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2993  flagellar basal-body rod protein FlgC  64.84 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31240  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.9 
 
 		 134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.652275  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2029  flagellar basal body rod protein  60.15 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0761  flagellar basal-body rod protein  50 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0839  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0135  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.29 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.09 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.04 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.14 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.17 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  32.61 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  37.31 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1710  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1558  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1532  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.123411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1521  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3635  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1675  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.81 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1742  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.85 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.41 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.82 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1820  flagellar basal body rod protein FlgC  30.66 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.82 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  31.39 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1764  flagellar basal body rod protein FlgC  29.71 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.69 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  34.07 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.61 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.61 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  31.39 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.41 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  31.16 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  29.71 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.04 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  35.1 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  32.61 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.97 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.93 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.85 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  34.06 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.14 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  29.71 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  34.78 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  28.26 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  33.33 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.39 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  32.19 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.03 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  32.19 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  32.39 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  28.26 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  26.47 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0051  putative flagellar basal body rod protein FlgC  35.34 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  31.97 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>