267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1648 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1648  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31240  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.91 
 
 		 134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.652275  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2029  flagellar basal body rod protein  63.16 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0980  protein of unknown function DUF1078 domain protein  61.94 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.442663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2993  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.2 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2349  protein of unknown function DUF1078 domain protein  59.54 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0839  hypothetical protein  53.12 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0761  flagellar basal-body rod protein  46.15 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.86 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1558  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1532  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.123411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1521  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1675  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1742  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1764  flagellar basal body rod protein FlgC  34.06 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3635  flagellar basal body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1820  flagellar basal body rod protein FlgC  34.06 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1710  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  35.51 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0135  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.14 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.29 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.69 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.48 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.72 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.88 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  33.58 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.29 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.84 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  34.33 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  31.11 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.37 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.09 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.62 
 
 		 145 aa  85.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.09 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.84 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  32.09 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  32.09 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.85 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.04 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.04 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.93 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.15 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  31.34 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.06 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.85 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  35.25 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  29.93 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  31.65 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  30 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.34 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  31.16 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.51 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.77 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  29.93 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.93 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.34 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  30.43 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.93 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.09 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  29.85 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  30.43 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0051  putative flagellar basal body rod protein FlgC  33.58 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.97 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.43 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>