216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1350 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
312 aa  641    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1023  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.45 
 
 
311 aa  269  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0127  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.79 
 
 
307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0853  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.58 
 
 
275 aa  249  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.388887  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1199  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.59 
 
 
308 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.54653  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0902  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.27 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.517739  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0832  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.95 
 
 
308 aa  231  9e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0940131  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.59 
 
 
312 aa  230  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.35704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1080  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.42 
 
 
314 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  29.84 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.62 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
341 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.63 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.82 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.18 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  30.03 
 
 
355 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.55 
 
 
338 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  29.61 
 
 
364 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.49 
 
 
350 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.3 
 
 
357 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.83 
 
 
325 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.83 
 
 
325 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.31 
 
 
355 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.03 
 
 
336 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  34.55 
 
 
371 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.61 
 
 
355 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.35 
 
 
379 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.52 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 
355 aa  99  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.86 
 
 
375 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  28.28 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.87 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.61 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.75 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0777  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.01 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.7 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.87 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  30.64 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.48 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.51 
 
 
348 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.35 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.03 
 
 
345 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.06 
 
 
361 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.37 
 
 
346 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.41 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.84 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.62 
 
 
792 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.43 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.04 
 
 
378 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.17 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.91 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.53 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.04 
 
 
339 aa  93.6  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.84 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.64 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  28.66 
 
 
343 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.72 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.92 
 
 
337 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  24.54 
 
 
327 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  28.41 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.72 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.62 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29 
 
 
332 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29 
 
 
332 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.97 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.57 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0312  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.7 
 
 
366 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.29 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.64 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.3 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.56 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.82 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.93 
 
 
335 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  24.22 
 
 
327 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.9 
 
 
771 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.03 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.03 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.15 
 
 
345 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.33 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.01 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.61 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.33 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.33 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.19 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.21 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.7 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.44 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.16 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  25.47 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.28 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.91 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.99 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.04 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.72 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.88 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.84 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.24 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.67 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.67 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>