More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3340 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  98.62 
 
 
436 aa  882    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  97.25 
 
 
436 aa  827    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  99.77 
 
 
436 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  76.61 
 
 
436 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  97.02 
 
 
436 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  71.33 
 
 
436 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  68.42 
 
 
437 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  65.83 
 
 
433 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  64.91 
 
 
433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  65.83 
 
 
433 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  62.61 
 
 
435 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  64.07 
 
 
434 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  64.07 
 
 
434 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  64.07 
 
 
434 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  39.59 
 
 
438 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  36.79 
 
 
435 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  38.72 
 
 
432 aa  269  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  33.26 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 
432 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
402 aa  96.3  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  23.6 
 
 
802 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.38 
 
 
844 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 
785 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 
810 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.43 
 
 
805 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 
808 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
770 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.31 
 
 
805 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 
797 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  22.96 
 
 
793 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  22.15 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.99 
 
 
808 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.39 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 
795 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 
805 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  22.81 
 
 
805 aa  80.1  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.75 
 
 
805 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 
807 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  21.43 
 
 
458 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 
801 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
789 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.25 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.52 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  21.38 
 
 
808 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  23.62 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 
798 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 
791 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  24.58 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0683  ABC transporter, permease protein, putative  24.53 
 
 
788 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0106782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 
780 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  24.25 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.27 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.82 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 
800 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  21.69 
 
 
798 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 
801 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.84 
 
 
800 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  21.03 
 
 
804 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.12 
 
 
657 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 
791 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.04 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 
797 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.9 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 
789 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 
809 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 
811 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.58 
 
 
882 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
798 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  25 
 
 
804 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.61 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.65 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  21.18 
 
 
806 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  23.17 
 
 
654 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  26.89 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  23.82 
 
 
807 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  22.05 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  21.6 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  22.35 
 
 
795 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  21.88 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  21.6 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
804 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 
836 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  22.16 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  22.82 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  19.91 
 
 
784 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  25.34 
 
 
653 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>