66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0782 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  100 
 
 
524 aa  1081    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  99.24 
 
 
524 aa  1075    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  99.43 
 
 
524 aa  1076    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  98.85 
 
 
524 aa  1071    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  81.7 
 
 
519 aa  863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  88.25 
 
 
524 aa  946    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  48.46 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  46.82 
 
 
515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  47.76 
 
 
515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  48.46 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  46.44 
 
 
515 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  45.63 
 
 
511 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  47.97 
 
 
1156 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  36.9 
 
 
529 aa  315  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  25.94 
 
 
536 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  25.94 
 
 
494 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  26.1 
 
 
494 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.65 
 
 
494 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  24.02 
 
 
487 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  26.43 
 
 
494 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.43 
 
 
494 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  26.43 
 
 
494 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  26.65 
 
 
494 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  23.74 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  26.23 
 
 
508 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  23.93 
 
 
524 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  24.16 
 
 
496 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  24.16 
 
 
496 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  25.13 
 
 
524 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.36 
 
 
528 aa  87.4  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.36 
 
 
528 aa  87.4  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  24.37 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  23.92 
 
 
532 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  25.38 
 
 
574 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  24.57 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  21.57 
 
 
537 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  24.93 
 
 
497 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  23.29 
 
 
511 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  25.28 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  25.05 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  26.78 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  22.46 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  23.46 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0649  hypothetical protein  34.17 
 
 
171 aa  74.7  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1686  bacteriophage capsid protein-like protein  34.17 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  23.46 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  21.92 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  23.54 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  24.52 
 
 
511 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  23.13 
 
 
531 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  26.17 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  24.06 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  22.79 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  25 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  22.75 
 
 
588 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  23.54 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  23.24 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  22.46 
 
 
516 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  22.6 
 
 
494 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  23.49 
 
 
510 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  26.79 
 
 
497 aa  53.9  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  22.2 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  22.15 
 
 
530 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  22.15 
 
 
530 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  21.84 
 
 
530 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  21.84 
 
 
530 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>