153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0063 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  99.28 
 
 		 139 aa  280  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  82.27 
 
 		 141 aa  237  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  81.56 
 
 		 141 aa  234  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  91.67 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  92.5 
 
 		 120 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4293  IS66 family transposase OrfA  84.62 
 
 		 52 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  37.86 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  38.69 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  38.69 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  38.69 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  33.57 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  37.84 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  54.55 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  32.17 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  32.17 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  40.79 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  28.95 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  34.21 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  38.36 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  33.96 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  32.71 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  39.74 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  35.9 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  43.75 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  36.99 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  45.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  45.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  45.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  45.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  45.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  45.83 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  32.05 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  32.05 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  32.05 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  43.75 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  36.76 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  36.76 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  43.75 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  43.75 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  37.74 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  35.85 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  36.99 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  35.9 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  42.55 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  42.55 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  42.55 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.67 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  43.75 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  36.11 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  46.51 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>