More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3633 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1418  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.39 
 
 
257 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.44 
 
 
246 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.29 
 
 
257 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.479548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187404  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
285 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
285 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
285 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
292 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
287 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.48 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.02 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
248 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.56 
 
 
248 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
244 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.15 
 
 
246 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
252 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.15 
 
 
246 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
249 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  32.1 
 
 
262 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
249 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
285 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.89 
 
 
248 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
256 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
285 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
248 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.455757  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
255 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0328  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.52 
 
 
241 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
252 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
252 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.52 
 
 
241 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
250 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0432  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.92 
 
 
241 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
297 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2760  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
241 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
247 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
259 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.732421  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
265 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609253  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
252 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
248 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
248 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.2 
 
 
250 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
251 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
284 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
287 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 
253 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2840  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
250 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
272 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2932  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
250 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.69 
 
 
243 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
305 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.3 
 
 
249 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
250 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
265 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
248 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
282 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
253 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3525  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.12 
 
 
241 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
248 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.397771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  28.11 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
260 aa  99  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.96 
 
 
248 aa  99  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
249 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.59 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.033772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.94 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.44 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.08 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4611  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.03 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>