More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3490 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.32 
 
 
394 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  38.27 
 
 
401 aa  242  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.37 
 
 
396 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.11 
 
 
356 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.7 
 
 
383 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  34.63 
 
 
365 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.74 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.29 
 
 
390 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.48 
 
 
398 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
392 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  29.49 
 
 
384 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.83 
 
 
427 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
362 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 
362 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.25 
 
 
383 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.18 
 
 
396 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  29.64 
 
 
414 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.46 
 
 
406 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  34.93 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  26.32 
 
 
425 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
425 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.58 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.44 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.66 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.18 
 
 
384 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  32.84 
 
 
405 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  32.5 
 
 
405 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.06 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.72 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  25.29 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.47 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 
419 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
415 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
376 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 
436 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.09 
 
 
423 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  31.09 
 
 
440 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.09 
 
 
440 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  32.06 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0586  Rieske-type ring hydroxylating dioxygenase alpha subunit  34.45 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.154111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.14 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2976  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
470 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.23 
 
 
398 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.93 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.83 
 
 
414 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.28 
 
 
413 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 
424 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
425 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.71 
 
 
423 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190649  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
440 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.35 
 
 
434 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.12 
 
 
423 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.43 
 
 
443 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1917  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.07 
 
 
458 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  25.07 
 
 
373 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.44 
 
 
408 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.17 
 
 
450 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.84 
 
 
403 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  25.07 
 
 
393 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
426 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
414 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
442 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.98 
 
 
429 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.665588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
430 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.56 
 
 
430 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0488  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.66 
 
 
455 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.06 
 
 
430 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.95 
 
 
414 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5626  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.01 
 
 
458 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0567  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.54 
 
 
458 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0662  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.17 
 
 
455 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  33.99 
 
 
444 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1642  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.54 
 
 
455 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2237  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.54 
 
 
458 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.39 
 
 
394 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.79 
 
 
410 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1668  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.54 
 
 
455 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779225  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1617  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.54 
 
 
455 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541424  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.16 
 
 
434 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33 
 
 
427 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02430  3-phenylpropionate dioxygenase, large (alpha) subunit  32.07 
 
 
453 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  32.07 
 
 
453 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  28.57 
 
 
432 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  25 
 
 
380 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  29.83 
 
 
437 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.63 
 
 
374 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02394  hypothetical protein  32.07 
 
 
453 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
413 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.11 
 
 
423 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  32.07 
 
 
453 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  32.07 
 
 
453 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>