47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1865 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  43.26 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  43.02 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  35.88 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  30.81 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  30.99 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  33.53 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  28.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  28.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  30.59 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  30.46 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  28.07 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  31.71 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  27.49 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  27.49 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  31.18 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  29.34 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  33.73 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  37.27 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.95 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  28.46 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  28.79 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  30.63 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  25.81 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  29.29 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  32.28 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  29.11 
 
 		 658 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.83 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  42.62 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  28.48 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  28.48 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  27.03 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  28.03 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  26.55 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  30.28 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  28.93 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  24.35 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  31.75 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  27.05 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.87 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0436  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.31 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  31.03 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>