93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4444 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4444  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 128 aa  237  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4047  hypothetical protein  92.97 
 
 		 155 aa  226  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183726  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3322  membrane protein of unknown function  52.46 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  51.64 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  50.41 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  50.85 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7918  membrane protein of unknown function  57.69 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.535574 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0790  hypothetical protein  47.97 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0645  membrane protein of unknown function  52.85 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.661895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  39.37 
 
 		 195 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  45.61 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  36.29 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  38.71 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  42.98 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  35.71 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  37.82 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  36.97 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  39.84 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  36.97 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8820  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0866999  normal  0.245817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  39.84 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  39.69 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  38.28 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0548  hypothetical protein  38.64 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02330  predicted membrane protein  32.26 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  42.98 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3822  membrane protein of unknown function  28.26 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  41.23 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  34.13 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  38.02 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4030  membrane protein of unknown function  27.61 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  33.63 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  35.04 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  34.68 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  34.58 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  34.19 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  34.82 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  33.93 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  39 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  32.48 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  33.88 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  33.93 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  30.97 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  32.23 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  28.1 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  34.45 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  28.57 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  32.8 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  37.39 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  35.16 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  48.15 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0053  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000164118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  36.07 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0671  membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.17092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  36.47 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  28.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  26.98 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  35.96 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  30.84 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  32.08 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  34.75 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  32.54 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  32.94 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  29.76 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 117 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  25.53 
 
 		 117 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  32.94 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  32.69 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  32.94 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  26.02 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 136 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  34.88 
 
 		 114 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  38.71 
 
 		 113 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>