More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4176 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  90.07 
 
 
533 aa  966    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  100 
 
 
534 aa  1103    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  43.88 
 
 
543 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  44.01 
 
 
554 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  44.92 
 
 
552 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.6 
 
 
586 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  39.73 
 
 
537 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  41.43 
 
 
560 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  40.43 
 
 
543 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  40.43 
 
 
543 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  40.52 
 
 
541 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
543 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  39.49 
 
 
541 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  41.02 
 
 
552 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  38.06 
 
 
547 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
543 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  39.76 
 
 
585 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  38.79 
 
 
561 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  37.07 
 
 
522 aa  336  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  38.08 
 
 
527 aa  325  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  37.15 
 
 
541 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  37.77 
 
 
528 aa  319  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  36.87 
 
 
546 aa  309  9e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  35.5 
 
 
546 aa  307  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  32.73 
 
 
543 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  36.89 
 
 
536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 
542 aa  277  4e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.01 
 
 
537 aa  256  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 
544 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
533 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.03 
 
 
536 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 
536 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.03 
 
 
536 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.24 
 
 
536 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.03 
 
 
536 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.08 
 
 
536 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.08 
 
 
536 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
531 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.42 
 
 
520 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  27.45 
 
 
530 aa  150  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  27.27 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
538 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  26.14 
 
 
544 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
561 aa  143  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.55 
 
 
545 aa  143  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
535 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 
594 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.57 
 
 
529 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
542 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
541 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
545 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.91 
 
 
528 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.91 
 
 
528 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.91 
 
 
528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.91 
 
 
528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 
526 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
545 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 
541 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
538 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  25 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  24.81 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  25 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  24.62 
 
 
537 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 
528 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  25.79 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 
530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  25.79 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  24.95 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 
560 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  25.79 
 
 
537 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
537 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  25.79 
 
 
537 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
537 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  25.79 
 
 
537 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  25.79 
 
 
537 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.18 
 
 
529 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.25 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  26.46 
 
 
538 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
526 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.24 
 
 
529 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  26.46 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  25.58 
 
 
537 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
544 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.95 
 
 
529 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.33 
 
 
521 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
533 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>