68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3085 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  56.22 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  57.3 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  54.05 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  53.44 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  53.44 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  53.44 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  52.69 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  53.44 
 
 		 186 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  53.85 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  53.48 
 
 		 186 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  53.23 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  53.23 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  52.69 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  46.77 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  46.49 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  32.19 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  31.14 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  32.88 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  32 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  32.88 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  28.73 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  28.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  30.82 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  28.65 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  23.73 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  23.73 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  29.85 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  29.85 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  26.63 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  26.42 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  24.32 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  23.81 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  27.54 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  27.38 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  27.38 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  22.4 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  22.46 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  23.78 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  23.78 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  24.49 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  23.7 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  21.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  25.53 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  23.12 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  22.54 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  22.49 
 
 		 190 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  22.82 
 
 		 192 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  22.87 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  20.36 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>