48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0501 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  99.48 
 
 
191 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  99.48 
 
 
191 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  91.1 
 
 
191 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  91.1 
 
 
191 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  91.1 
 
 
191 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  91.1 
 
 
191 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  91.1 
 
 
191 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  82.2 
 
 
191 aa  340  8e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  61.98 
 
 
192 aa  255  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  62.23 
 
 
188 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  63.68 
 
 
188 aa  235  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  61.17 
 
 
189 aa  225  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  56.45 
 
 
187 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  56.45 
 
 
187 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  57.14 
 
 
189 aa  208  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  37.77 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  30.92 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  27.57 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  29.61 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  28.74 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  27.07 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  23.37 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  24.46 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  23.91 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  23.91 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  23.37 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  27.81 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  23.37 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  23.37 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  26.49 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  22.95 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  24.66 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  24.49 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  22.76 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  21.71 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  22.92 
 
 
196 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>