44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2596 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  62.16 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  61.97 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  57.97 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  58.33 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  57.53 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  55.26 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  55.26 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  56.79 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  56.94 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  48.61 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  72.5 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.76 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  42.86 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  44.59 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  43.04 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  50 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  51.39 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  60 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.84 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  42.67 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  36.36 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.6 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.6 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  41.56 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  38.81 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  54.05 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  30.88 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.67 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  36.67 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.78 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  42.25 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  45.95 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  38.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  35.71 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  48.72 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  34.38 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  33.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.9 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  43.9 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  34.33 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.9 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  37.93 
 
 		 92 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>