184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0995 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  100 
 
 
121 aa  238  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  37.39 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  34.45 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  36.13 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  32 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  33.61 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  35.14 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  34.51 
 
 
301 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  28.07 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  38.18 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  33.91 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  33.93 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  35.4 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  29.17 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  35.71 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  31.19 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  34.82 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  35 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  33.61 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  30.91 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  30 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  33.63 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  31.4 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  33.67 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  26.36 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  32.74 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  34.48 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  35.34 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  31.53 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  31.53 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  32.74 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  30 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  38.71 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  27.78 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  27.5 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  27.5 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  30.25 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  32.56 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  31.86 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  28.33 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1628  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  34.72 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161225  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  30.51 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  28.81 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
128 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  27.55 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  29.75 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  30.83 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  28.93 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  26.23 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  27.78 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  29.73 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1675  putative flagellar protein FliS  31.94 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  32.41 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0040  putative flagellar protein FliS  31.94 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  32.41 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  29.06 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  32.73 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  29.25 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  28.46 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>