80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1628 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1628  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  100 
 
 		 129 aa  263  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1675  putative flagellar protein FliS  84.92 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0040  putative flagellar protein FliS  85.71 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  34.72 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  29.84 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  30 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0212  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  34.43 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.523673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  33.62 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  30 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  32.76 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  32.38 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  30.25 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  28.04 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  29.91 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  27.72 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  32.38 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  28.16 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  38.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  38.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  38.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  38.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  38.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  30.91 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  25.98 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  31.43 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  30.91 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  30.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  30.39 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  27.41 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  26.92 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  27.38 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  30.39 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  40.68 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  25.24 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  27.62 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  29.52 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  36.99 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  28.99 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  46.34 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  28.17 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  32.08 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  39.02 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  25.42 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  36.67 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  28.21 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  25.62 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  25.62 
 
 		 140 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  27.94 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  25.86 
 
 		 137 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  30.43 
 
 		 137 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  25.86 
 
 		 137 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  24.58 
 
 		 130 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  30.43 
 
 		 137 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  24.58 
 
 		 130 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  27.64 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  27.94 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  28.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0869  flagellar protein FliS  24.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  36.21 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  26.67 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  24.6 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  30.51 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  26.27 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 136 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>