77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1675 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1675  putative flagellar protein FliS  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0040  putative flagellar protein FliS  98.41 
 
 
126 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1628  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  84.5 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161225  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  30.53 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0212  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  35.59 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.523673  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  31.75 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  31.75 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  35.11 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  32.2 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  29.85 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  29.06 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  26.72 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  28.8 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  41.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  41.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  41.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  41.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  41.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  30.56 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  28.33 
 
 
126 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  30 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  27.45 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  29.31 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  38.98 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  37.31 
 
 
301 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  28.12 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  26.67 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  27.78 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  25.64 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  31.07 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  25.64 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  27.62 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  41.54 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  27.54 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  28.44 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  25.86 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  28.17 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  41.54 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  30.25 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  28.45 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  28.45 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  27.12 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  26.45 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  22.76 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3637  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
126 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  28.43 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  27.12 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  25.22 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  26.47 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  34.29 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  27.34 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  27.36 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  34.29 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  28.91 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  27.27 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  27.34 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  24.19 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  29.41 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  32.84 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.23 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  26.09 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  29.52 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>