125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0212 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0212  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.523673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  32.79 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  31.97 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  31.97 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  29.51 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  35.66 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  31.67 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  31.93 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  30.88 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  30.95 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  36.13 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  36.75 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  31.71 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  32.23 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  31.78 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  33.94 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  27.87 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  32.28 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  32.23 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1628  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  34.43 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  28.57 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2921  flagellar protein FliS  34.52 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  30.25 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  30.58 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  31.03 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  28.12 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  30.33 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1675  putative flagellar protein FliS  35.59 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  31.25 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  30.17 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  27.42 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  32.48 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  35.04 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  34.19 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  34.68 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.16 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  30.16 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  33.05 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  34.4 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  31.75 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  28.12 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  28.97 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  33.85 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  32.76 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  33.64 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  31.45 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  32.14 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  28.46 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  34.92 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  34.29 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  32.14 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0040  putative flagellar protein FliS  40.91 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  33.61 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  32.28 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  30.08 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  28.1 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  26.55 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  29.06 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  26.21 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  25.22 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  27.18 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  25.22 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  24.77 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  31.75 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  27.35 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50250  flagellar protein FliS  29.91 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194402  decreased coverage  0.0000900366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  29.92 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  31.75 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  30.89 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  26.5 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  29.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  28.23 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  26.67 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>