More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0610 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.54 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  32.17 
 
 
271 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  31.74 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  27.23 
 
 
271 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.97 
 
 
290 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  34.51 
 
 
241 aa  105  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  24.91 
 
 
291 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.08 
 
 
290 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  32.3 
 
 
244 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.86 
 
 
290 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  27.31 
 
 
271 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 
244 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.35 
 
 
299 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.78 
 
 
268 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.04 
 
 
290 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.72 
 
 
299 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.17 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.69 
 
 
290 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.59 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.59 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.7 
 
 
267 aa  95.5  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.59 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  26.59 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.59 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  27.24 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.51 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  26.42 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.3 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.47 
 
 
277 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.98 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.4 
 
 
269 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  26.56 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.02 
 
 
287 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  31.17 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.3 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.72 
 
 
271 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 
287 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 
286 aa  92  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  25.59 
 
 
288 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  24.61 
 
 
285 aa  91.7  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.17 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.26 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.57 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.57 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.57 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  27.35 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.45 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  26.82 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.57 
 
 
290 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.91 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.35 
 
 
291 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.39 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.39 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.69 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  29.32 
 
 
293 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  26.44 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  28 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  25.94 
 
 
277 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  30.94 
 
 
263 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  25.94 
 
 
277 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.66 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.39 
 
 
269 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  28.45 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  28.51 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.69 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  26.96 
 
 
296 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.97 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  26.27 
 
 
293 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.66 
 
 
298 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  25.58 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.66 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.89 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.94 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.66 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.66 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  25.53 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  28.02 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.02 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.39 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  26.22 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  26.22 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  29.11 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.34 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>