More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0285 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0285  ribosomal protein S3  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105887  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0271  ribosomal protein S3  66.07 
 
 		 231 aa  318  5e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  56.6 
 
 		 210 aa  255  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  56.6 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 229 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  55.19 
 
 		 211 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  55.66 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 210 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 229 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  54.72 
 
 		 211 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  54.72 
 
 		 211 aa  248  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  55.98 
 
 		 223 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  53.15 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 219 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  52.49 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  56.81 
 
 		 222 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 239 aa  244  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  53.77 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  51.12 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 251 aa  241  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  49.31 
 
 		 285 aa  241  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  55.4 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  55.4 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  55.4 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 233 aa  241  9e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1298  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000309982  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  53.3 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  56.6 
 
 		 219 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3789  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 298 aa  238  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.461405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  49.54 
 
 		 256 aa  238  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0284  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 288 aa  238  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128971  hitchhiker  0.0000000454249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0279  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 288 aa  238  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000626052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 290 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1388  ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 209 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>