More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0030 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0030  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 523 aa  1052    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0840  NADH dehydrogenase (quinone)  57.99 
 
 		 516 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.882058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0721  NADH dehydrogenase (quinone)  55.58 
 
 		 516 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3018  NADH dehydrogenase (quinone)  54.49 
 
 		 519 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1392  formate dehydrogenase, beta subunit  56.39 
 
 		 516 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0554  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  55.82 
 
 		 518 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2275  NADH dehydrogenase (quinone)  53.94 
 
 		 522 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2384  NADH dehydrogenase (quinone)  52.85 
 
 		 518 aa  606  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0388  NADH dehydrogenase (quinone)  53.83 
 
 		 523 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2057  formate dehydrogenase, beta subunit  54.39 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.657575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3637  NADH dehydrogenase (quinone)  55.03 
 
 		 518 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288209  normal  0.948278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3480  NADH dehydrogenase (quinone)  54.72 
 
 		 520 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3807  normal  0.394192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2751  NADH dehydrogenase (quinone)  52.99 
 
 		 523 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3926  NADH dehydrogenase (quinone)  54.94 
 
 		 518 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4098  NADH dehydrogenase I chain F  55.45 
 
 		 518 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3090  putative formate dehydrogenase beta subunit  54.09 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0728  NADH dehydrogenase (quinone)  53.35 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  0.849063 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2963  formate dehydrogenase, beta subunit  53.15 
 
 		 527 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2353  NADH dehydrogenase (quinone)  53.47 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.691857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2901  formate dehydrogenase, beta subunit  53.15 
 
 		 521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2898  NADH dehydrogenase (quinone)  53.36 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0449  formate dehydrogenase, beta subunit  52.95 
 
 		 521 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3011  NAD-dependent formate dehydrogenase beta subunit  52.95 
 
 		 521 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0181  formate dehydrogenase, beta subunit  52.95 
 
 		 521 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0908  NADH dehydrogenase (quinone)  54.13 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0101124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0896  NADH dehydrogenase (quinone)  54.13 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0966  formate dehydrogenase, beta subunit  52.95 
 
 		 521 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4913  NADH dehydrogenase (quinone)  52.28 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.849952  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2594  formate dehydrogenase, beta subunit  52.95 
 
 		 521 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4997  NADH dehydrogenase (quinone)  51.49 
 
 		 519 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4023  formate dehydrogenase, beta subunit  51.46 
 
 		 537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  53.94 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0256  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.66 
 
 		 519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0618  NADH dehydrogenase (quinone)  54.9 
 
 		 521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0804  NADH dehydrogenase (quinone)  53.59 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4145  NADH dehydrogenase (quinone)  53.15 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1623  formate dehydrogenase, beta subunit  52.56 
 
 		 522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0553  NADH dehydrogenase (quinone)  53.74 
 
 		 525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1032  NADH dehydrogenase (quinone)  53.74 
 
 		 525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3022  NADH dehydrogenase (quinone)  52.95 
 
 		 520 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689492  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2184  NADH dehydrogenase (quinone)  50.78 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1079  NAD dependent formate dehydrogenase, beta subunit (51 kDa)  52.82 
 
 		 509 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0989  NADH dehydrogenase (quinone)  53.31 
 
 		 516 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  54.15 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3709  NADH dehydrogenase (quinone)  52.22 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3553  NADH dehydrogenase (quinone)  50.29 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4405  NADH dehydrogenase (quinone)  50.89 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2365  NADH dehydrogenase (quinone)  53.94 
 
 		 525 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2740  NADH dehydrogenase (quinone)  52.82 
 
 		 509 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0725  NADH dehydrogenase (quinone)  52.82 
 
 		 518 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4868  NADH dehydrogenase (quinone)  50.89 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1707  NADH dehydrogenase (quinone)  51.26 
 
 		 519 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  53.01 
 
 		 518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2854  NADH dehydrogenase (quinone)  52.23 
 
 		 509 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4646  NADH dehydrogenase (quinone)  53.01 
 
 		 518 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0965  NAD-dependent formate dehydrogenase, beta subunit  52.05 
 
 		 521 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1808  NADH dehydrogenase (quinone)  49.9 
 
 		 519 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2857  NADH dehydrogenase (quinone)  52.93 
 
 		 513 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2559  NADH dehydrogenase (quinone)  51.84 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1860  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  50.39 
 
 		 727 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2683  NADH dehydrogenase (quinone)  48.82 
 
 		 511 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1474  NADH dehydrogenase (quinone)  50.71 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.489293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0733  NADH dehydrogenase (quinone)  47.44 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  44.6 
 
 		 607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  46.33 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  44.6 
 
 		 607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  44.71 
 
 		 602 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  43.44 
 
 		 610 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  44.12 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  45.33 
 
 		 623 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  45.07 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  42.03 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  42.44 
 
 		 597 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  43.84 
 
 		 590 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  43.92 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  44.36 
 
 		 619 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  43.95 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  43.63 
 
 		 588 aa  412  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  44.93 
 
 		 604 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  45.65 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  41.12 
 
 		 614 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  43.43 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  41.52 
 
 		 562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  42.43 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  43.19 
 
 		 538 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.46 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  42.58 
 
 		 593 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  44.34 
 
 		 545 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  47.09 
 
 		 535 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.68 
 
 		 593 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  44.34 
 
 		 545 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  42.47 
 
 		 593 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  45.58 
 
 		 596 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 		 530 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.51 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  44.6 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>