40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1915 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 389 aa  743    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  20.39 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  20.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  23.19 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  20.7 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  20.24 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  23.97 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  23.97 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  23.97 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  26.62 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  19.73 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  24 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  20.74 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  20 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  20 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  21.1 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  20.65 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  35.78 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 524 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>