More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1821 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  80.92 
 
 
131 aa  222  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  60.36 
 
 
129 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  49.54 
 
 
166 aa  115  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  50.46 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 
172 aa  113  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  41.84 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  41.55 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  51.89 
 
 
173 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  50.88 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  51.92 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 
164 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  47.71 
 
 
172 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 
169 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 
172 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 
172 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  44.64 
 
 
185 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  46.43 
 
 
188 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  49.06 
 
 
156 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  49.06 
 
 
156 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  49.53 
 
 
164 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  49.06 
 
 
156 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  49.06 
 
 
156 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 
169 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  40.71 
 
 
187 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  48.11 
 
 
167 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  48.11 
 
 
167 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 
111 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  42.31 
 
 
138 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  41.67 
 
 
142 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  41.67 
 
 
142 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  37.59 
 
 
133 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  47.66 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38.96 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  45.71 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.1 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2133  single-strand binding protein  37.38 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000570292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2171  single-strand binding protein  37.38 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00228216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  45.28 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  36.72 
 
 
125 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  36.72 
 
 
125 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  44.23 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 
111 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  36.92 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  36.36 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  39.62 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  35.77 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  37.4 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
121 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  34.53 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  44.23 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  38.81 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  37.4 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.89 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  41.9 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  41.58 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  43.27 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  36.97 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  37.4 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  40 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  41.35 
 
 
150 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  41.35 
 
 
150 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  35.14 
 
 
151 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  41.35 
 
 
148 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  40.38 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  40.37 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  38.68 
 
 
172 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  38.03 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  35.96 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  35.96 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  39.62 
 
 
165 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  38.14 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  31.94 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  38.1 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  38.83 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  36.43 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40.95 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  38.18 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  42.48 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.68 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  37.82 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  37.82 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  35.92 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  37.82 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  37.82 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  37.74 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>