More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0394 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  90.91 
 
 
209 aa  391  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  81.99 
 
 
211 aa  355  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  70.14 
 
 
211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  70.81 
 
 
209 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  72.28 
 
 
203 aa  317  9e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  71.77 
 
 
209 aa  317  1e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  68.9 
 
 
209 aa  315  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  68.42 
 
 
209 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 
209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  69.38 
 
 
209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
209 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  66.99 
 
 
209 aa  305  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  66.51 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  67.46 
 
 
209 aa  303  8.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
226 aa  299  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  63.64 
 
 
209 aa  293  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  64.11 
 
 
209 aa  291  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
209 aa  290  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  67.16 
 
 
210 aa  290  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  64.59 
 
 
209 aa  290  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
209 aa  289  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  66.18 
 
 
209 aa  288  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  65.2 
 
 
213 aa  287  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
370 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  60.77 
 
 
209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  62.25 
 
 
207 aa  279  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  59.81 
 
 
209 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  59.62 
 
 
211 aa  277  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
220 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 
208 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 
216 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 
216 aa  274  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  58.45 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
216 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  59.51 
 
 
211 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  57.35 
 
 
220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 
211 aa  268  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 
208 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  59.42 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 
210 aa  268  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  57 
 
 
215 aa  267  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
208 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
227 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  59.71 
 
 
210 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
209 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  59.8 
 
 
205 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 
208 aa  265  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
209 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
209 aa  264  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  264  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
209 aa  264  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
209 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
209 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
209 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
210 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
209 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 
213 aa  260  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  55.77 
 
 
211 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
209 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  60.19 
 
 
216 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
209 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 
216 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 
216 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 
216 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 
232 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 
216 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 
238 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 
216 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  61.65 
 
 
216 aa  257  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
214 aa  256  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
214 aa  256  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 
210 aa  256  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  60.19 
 
 
216 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2718  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 
209 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 
210 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 
210 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  59.22 
 
 
207 aa  254  7e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  60.78 
 
 
216 aa  254  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 
303 aa  252  3e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
207 aa  252  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
207 aa  251  5.000000000000001e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 
214 aa  251  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0746  uracil phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 
212 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 
216 aa  249  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0787  uracil phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 
212 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.785203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
214 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>