68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3711 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  87.79 
 
 		 344 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  92.75 
 
 		 345 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  93.04 
 
 		 345 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  92.46 
 
 		 345 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  88.08 
 
 		 344 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  88.08 
 
 		 344 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  89.28 
 
 		 345 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  87.79 
 
 		 344 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  73.26 
 
 		 345 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  61.61 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  41.13 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  41.11 
 
 		 396 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  37.96 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  39.66 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  39.66 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  36.93 
 
 		 514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  37.17 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  37.5 
 
 		 523 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  37.54 
 
 		 530 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  36.51 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  38.99 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  36.3 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  35.94 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  31.78 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  29.36 
 
 		 427 aa  155  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  42.11 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  30 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  34.57 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  32.01 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  29.89 
 
 		 721 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  33.25 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  29.66 
 
 		 474 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.1 
 
 		 432 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  30.7 
 
 		 595 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  34.93 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  35.19 
 
 		 357 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  33.44 
 
 		 777 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 456 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  34.29 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  33.11 
 
 		 566 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  30.77 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.35 
 
 		 831 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  33.13 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 632 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  32.41 
 
 		 503 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  31.31 
 
 		 520 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  31.46 
 
 		 514 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  36.84 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  24.28 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  24.91 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  26.14 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  23.72 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  27.41 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  25.98 
 
 		 1118 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25 
 
 		 726 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  25.51 
 
 		 530 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  25.86 
 
 		 815 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  30.38 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  28.85 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  27.98 
 
 		 698 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.06 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  25.11 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  27.32 
 
 		 768 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  25.98 
 
 		 1892 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 615 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>