191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2367 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  100 
 
 		 396 aa  794    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  77.32 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  77.32 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.43 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.04 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.8 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.19 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.04 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 447 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0202  hypothetical protein  21.96 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0349216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.58 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.06 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.89 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  22.81 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  24.79 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  25 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  22.39 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.71 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.71 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  21.48 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  24.37 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  24.37 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  24.37 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.4 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  21.39 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  24.57 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  23.14 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  22.08 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  24.37 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  23.33 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.59 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  22.41 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  20.45 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  22.66 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  23.12 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  22.41 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  22.41 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  22.41 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  21.75 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  22.41 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  22.63 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  22.36 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.31 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1651  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  23.5 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  22.17 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>