More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1831 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  100 
 
 
346 aa  695    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  89.53 
 
 
346 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  71.6 
 
 
342 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  69.41 
 
 
341 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  48.73 
 
 
355 aa  328  7e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  48.75 
 
 
358 aa  315  8e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  47.46 
 
 
354 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  47.35 
 
 
357 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  47.49 
 
 
357 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  47.49 
 
 
357 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  46.48 
 
 
354 aa  289  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  45.89 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  44.99 
 
 
348 aa  276  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  45 
 
 
291 aa  272  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  44.79 
 
 
350 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  43.53 
 
 
291 aa  252  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  42.73 
 
 
292 aa  249  6e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  45.9 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  45.73 
 
 
321 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.67 
 
 
294 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  43.99 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  43.99 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.35 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  44.38 
 
 
292 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  44.61 
 
 
295 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.61 
 
 
295 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.61 
 
 
295 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  44.31 
 
 
295 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  44.31 
 
 
295 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  44.31 
 
 
295 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  44.31 
 
 
295 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  44.31 
 
 
295 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  45.2 
 
 
320 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.01 
 
 
295 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  40.53 
 
 
297 aa  223  3e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  44.01 
 
 
295 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  44.01 
 
 
295 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  40.71 
 
 
291 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  42.82 
 
 
290 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  38.87 
 
 
292 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  38.26 
 
 
292 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  38.28 
 
 
293 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  38.17 
 
 
295 aa  206  4e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  39.77 
 
 
310 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  39.47 
 
 
293 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.12 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  39.35 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.58 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  39.35 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  39.35 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  39.35 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  38.76 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  38.46 
 
 
283 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  39.05 
 
 
283 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  39.47 
 
 
291 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  39.7 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  38.02 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  36.76 
 
 
292 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  37.83 
 
 
291 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  40.59 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  36.47 
 
 
292 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  40.61 
 
 
292 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  39.83 
 
 
313 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  39.28 
 
 
307 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  36.83 
 
 
292 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  38.46 
 
 
283 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  38.76 
 
 
291 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  37.87 
 
 
283 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  37.87 
 
 
283 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  40.96 
 
 
287 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  36.23 
 
 
292 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  38.48 
 
 
312 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  39.41 
 
 
285 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  40.7 
 
 
298 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  40.7 
 
 
298 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  37.75 
 
 
308 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  40.12 
 
 
298 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  38.21 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  37.47 
 
 
312 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  36.72 
 
 
291 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  38.37 
 
 
290 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  36.98 
 
 
289 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  37.14 
 
 
296 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  36.75 
 
 
293 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  36.75 
 
 
293 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  37.54 
 
 
294 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  36.81 
 
 
307 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  38.26 
 
 
310 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  36.75 
 
 
293 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  38.85 
 
 
269 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  36.75 
 
 
293 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  36.75 
 
 
293 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>