189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2353 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  69.14 
 
 		 164 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  66.46 
 
 		 164 aa  227  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  64.2 
 
 		 162 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  64.81 
 
 		 163 aa  224  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  66.05 
 
 		 162 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  65.43 
 
 		 163 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  64.81 
 
 		 163 aa  222  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  65.43 
 
 		 163 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  65.43 
 
 		 163 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  65.43 
 
 		 163 aa  220  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  63.41 
 
 		 163 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  59.26 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  55.56 
 
 		 163 aa  187  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  50 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  52.73 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  48.15 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  49.09 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  56.12 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  54.55 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  49.69 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  50.92 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  50 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  51.53 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  47.17 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  45.4 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  42.93 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  44.97 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  44.32 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  53.62 
 
 		 141 aa  141  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  43.03 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  42.86 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  43.24 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  40.32 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  39.78 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  41.08 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.42 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  36.14 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  38.75 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  38.51 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  33.95 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  41.33 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  40.27 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  36.3 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  36.02 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  40.67 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  32.93 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  39.33 
 
 		 150 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  35.52 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  37.91 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  40.43 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  58.02 
 
 		 90 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  32.58 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  32.26 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  32.76 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  34.27 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  31.43 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  29.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  27.07 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  31.07 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  35.98 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  28.73 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  30.34 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  30.34 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  28.65 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  30.34 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  31.03 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  32.58 
 
 		 291 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  32 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  31.67 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  31.61 
 
 		 256 aa  60.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  27.84 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  26.7 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  30.41 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  30.11 
 
 		 236 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  30.41 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  30.41 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  26.7 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  28.1 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2668  carbonic anhydrase  29.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  28.1 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  31.13 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  27.46 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  25.26 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  26.59 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  29.07 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  28.4 
 
 		 215 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0867  carbonic anhydrase  26.77 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0728812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  34.92 
 
 		 768 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  34.92 
 
 		 768 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1257  putative carbonic anhydrase precursor  27.27 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3696  carbonic anhydrase  30.07 
 
 		 251 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>