More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2146 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  62.35 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  63.75 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  55.17 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  59.49 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0460  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000738553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_426  ribosomal protein S17  48.75 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 86 aa  97.1  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  55.56 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  55.29 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  54.32 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  50 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  58.75 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 87 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2848  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  55 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0687  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0483  30S ribosomal protein S17  47.5 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  56.63 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0217  ribosomal protein S17  48.78 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  55.84 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  54.32 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  57.69 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  55.13 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  51.85 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  48.19 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 93 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  47.13 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>