More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0217 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0217  ribosomal protein S17  100 
 
 		 125 aa  253  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  50 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  48.78 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  47.73 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  48.78 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  50.6 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  51.16 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  45.88 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  53.01 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  50 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  49.4 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  46.34 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  48.78 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  45.98 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0486  ribosomal protein S17  50.59 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  48.78 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  44.19 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  46.91 
 
 		 88 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  50.62 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  47.19 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4923  ribosomal protein S17  46.43 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  51.22 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  47.44 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  45.78 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  46.59 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  48.15 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  46.99 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  48.15 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  51.22 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  48.31 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  45.35 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  46.99 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  42.68 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  48.78 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  44.19 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  49.4 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  45.12 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  44.83 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  43.68 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  47.44 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  44.44 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  44.44 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  44.44 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  49.32 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  44.58 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  43.68 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  46.34 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  42.53 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  46.51 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  43.68 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  46.34 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  44.94 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  45.68 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  48.68 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  48.19 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  46.34 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  40.21 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  48.19 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  49.41 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  43.9 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0203  SSU ribosomal protein S17P  46.91 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255789  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  45.12 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  48.65 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  41.38 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  47.62 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  45.68 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  44.3 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  44.71 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  45 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  42.53 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  47.62 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  45.33 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>