More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1152 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1152  ribosomal protein S17  100 
 
 		 88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000241067  hitchhiker  0.000026776 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  74.12 
 
 		 86 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  67.06 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  67.47 
 
 		 87 aa  120  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  64.37 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  64.63 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  56.82 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  58.14 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  55.68 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  57.47 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  57.65 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  56.32 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  58.54 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0217  ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  55.17 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1474  SSU ribosomal protein S17P  59.52 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677491  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  54.65 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0604  SSU ribosomal protein S17P  55.95 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  57.14 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  54.02 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  59.04 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  59.76 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2393  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000222065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  54.12 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  53.49 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  59.26 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.22 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 99 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  58.02 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1898  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 86 aa  90.1  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0030957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  52.87 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  54.02 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  52.87 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  52.27 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  50.57 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  54.02 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0407  ribosomal protein S17  50 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  50.57 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  53.66 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  51.81 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  51.72 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  51.9 
 
 		 190 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  52.44 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  51.72 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2268  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 87 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00046629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2309  30S ribosomal protein S17  56.79 
 
 		 87 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1822  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.308376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  51.16 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  50.62 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  50.57 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0724  ribosomal protein S17  50.63 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  50 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  48.81 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  49.38 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  49.38 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>