More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3148 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3148  inner-membrane translocator  100 
 
 
336 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3502  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  98.51 
 
 
336 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  46.63 
 
 
351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  46.93 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  46.93 
 
 
351 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  48.66 
 
 
347 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4404  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  48.66 
 
 
347 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4321  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  48.66 
 
 
347 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  48.37 
 
 
347 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4291  inner membrane ABC transporter permease YdeY  48.21 
 
 
346 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  48.45 
 
 
332 aa  262  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1658  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  49.55 
 
 
342 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2132  Monosaccharide-transporting ATPase  48.96 
 
 
342 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2127  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  48.66 
 
 
342 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2144  monosaccharide-transporting ATPase  48.66 
 
 
342 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1596  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  48.66 
 
 
342 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  48.29 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  39.09 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 
317 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  39.07 
 
 
317 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  39.07 
 
 
317 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  37.79 
 
 
317 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 
317 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  37.79 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  40.77 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 
322 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  40.18 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
314 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  31.12 
 
 
334 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  37.92 
 
 
363 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 
332 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  38.98 
 
 
339 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
317 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.21 
 
 
310 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.21 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 
835 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
352 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 
332 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 
342 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  36.07 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.7 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  30.13 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  33.87 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.7 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.63 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.56 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  34.05 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  34.95 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 
352 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 
346 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.73 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3273  putative ABC transporter, permease protein,y4mJ-like protein  32.36 
 
 
332 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.715289  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 
332 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 
353 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
346 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
350 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  32.38 
 
 
332 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.77 
 
 
317 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  30.63 
 
 
333 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2303  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
340 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  31.88 
 
 
320 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.98 
 
 
331 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.33 
 
 
325 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.04 
 
 
336 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 
325 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  37.12 
 
 
342 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  33.58 
 
 
329 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
311 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 
320 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.59 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  32.47 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  27.33 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  34.95 
 
 
317 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.74 
 
 
345 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  32.37 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.73 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.41 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  31.07 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.07 
 
 
311 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>