48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0137 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 586 aa  1181    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  49.33 
 
 		 599 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  39.47 
 
 		 600 aa  356  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  36.2 
 
 		 624 aa  320  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  32.55 
 
 		 696 aa  293  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  34.7 
 
 		 689 aa  290  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  38.94 
 
 		 687 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  35.13 
 
 		 612 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  39.15 
 
 		 641 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  31.4 
 
 		 1179 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  29.2 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  31.1 
 
 		 623 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  31.57 
 
 		 669 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  32.77 
 
 		 667 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  31.97 
 
 		 671 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  29.33 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  36.28 
 
 		 689 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  30.98 
 
 		 668 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  30.98 
 
 		 640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  34.71 
 
 		 652 aa  173  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  33.72 
 
 		 1156 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  33.72 
 
 		 651 aa  171  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  33.72 
 
 		 651 aa  171  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  30.9 
 
 		 656 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  33.52 
 
 		 674 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  33.54 
 
 		 620 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  33.44 
 
 		 684 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  33.44 
 
 		 684 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  33.44 
 
 		 683 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  31.05 
 
 		 684 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  28.99 
 
 		 688 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  29.72 
 
 		 780 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  29.72 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  27.9 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  28.24 
 
 		 770 aa  99.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  29.7 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  43.52 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  34.34 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  36.96 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3410  hypothetical protein  26.72 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  33.53 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  34.13 
 
 		 624 aa  54.7  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  34.13 
 
 		 624 aa  54.7  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  36.88 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  36.88 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  24.56 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  34.15 
 
 		 244 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  38.83 
 
 		 167 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>