148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3449 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
161 aa  297  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  44.37 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  43.61 
 
 
148 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.78 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  44.93 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  41.67 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  46.55 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  44.27 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  41.27 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.48 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  41.23 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  46.77 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  45.22 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  37.39 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  31.78 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  39.23 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  41.88 
 
 
322 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  38.13 
 
 
328 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  43.88 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  37.96 
 
 
323 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  41.74 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
340 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
322 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  37.23 
 
 
323 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  43.48 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  41.03 
 
 
352 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  36.5 
 
 
324 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  38.41 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  45.61 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  37.41 
 
 
328 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  36.5 
 
 
324 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  36.5 
 
 
324 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.61 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  32.35 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  43.88 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  31.13 
 
 
322 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  32.52 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  34.41 
 
 
330 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  39.17 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  37.11 
 
 
339 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  33.06 
 
 
311 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  39.52 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  39.09 
 
 
186 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  32.33 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  41.8 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  33.78 
 
 
330 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  41.1 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  37.23 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  36.84 
 
 
339 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  36.36 
 
 
310 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  36.46 
 
 
309 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  35.14 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  27.44 
 
 
319 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  37.14 
 
 
318 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 
305 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  34.02 
 
 
310 aa  55.1  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  42.53 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  34.69 
 
 
309 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  34.02 
 
 
339 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  35 
 
 
311 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  29.46 
 
 
311 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  35.14 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  35.48 
 
 
333 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  32.31 
 
 
320 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  30.51 
 
 
308 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  38.66 
 
 
325 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  34.91 
 
 
318 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  40.57 
 
 
318 aa  54.7  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  31.08 
 
 
331 aa  54.3  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  35.85 
 
 
318 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  35.85 
 
 
318 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  33.96 
 
 
316 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  31.19 
 
 
308 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  34.91 
 
 
318 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  32.05 
 
 
346 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  32.63 
 
 
340 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  35 
 
 
311 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  44.71 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  36 
 
 
312 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
309 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>