120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1398 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  100 
 
 
179 aa  340  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  95.53 
 
 
175 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  81.42 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  59.02 
 
 
141 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  50.34 
 
 
175 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  53.85 
 
 
155 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  55.96 
 
 
186 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  51.56 
 
 
153 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  48.44 
 
 
149 aa  94.4  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  55.12 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  48.98 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  51.97 
 
 
168 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  45.67 
 
 
146 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  46.04 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  40.56 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.61 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  49.63 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  46.34 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  43.41 
 
 
148 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  48.81 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  34.33 
 
 
313 aa  74.7  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  41.09 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  50.48 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.46 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  46.55 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  46.28 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  45.16 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  49.51 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  42.37 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  44.72 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  43.27 
 
 
140 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  36.73 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  42.37 
 
 
142 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  32.35 
 
 
319 aa  61.6  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  28.03 
 
 
310 aa  59.7  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  38.14 
 
 
144 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  34.04 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  35.77 
 
 
312 aa  54.7  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  32.62 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  32.62 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
333 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  39.42 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  34.53 
 
 
319 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  47.13 
 
 
161 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  31.11 
 
 
320 aa  51.2  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  29.41 
 
 
321 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  41.03 
 
 
320 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  31.21 
 
 
322 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  38.04 
 
 
309 aa  48.9  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  46.84 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  26.12 
 
 
320 aa  47.8  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  28.36 
 
 
307 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  28.36 
 
 
307 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  34.57 
 
 
308 aa  46.6  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  39.24 
 
 
310 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  30.6 
 
 
346 aa  45.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
322 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  31.91 
 
 
330 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
352 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  33.58 
 
 
340 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
310 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 
310 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  39.24 
 
 
310 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  31.21 
 
 
332 aa  44.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  29.5 
 
 
319 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  33.82 
 
 
318 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  32.33 
 
 
311 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  34.29 
 
 
315 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  36.27 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  28.15 
 
 
319 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  33.82 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  36 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.39 
 
 
310 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  28.67 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  28.97 
 
 
340 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  31.39 
 
 
310 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  39.24 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  36.22 
 
 
323 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  32.35 
 
 
318 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  48.48 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  28.36 
 
 
305 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  30.3 
 
 
308 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>