118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0441 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  100 
 
 
168 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  79.29 
 
 
169 aa  255  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  60.48 
 
 
180 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  57.74 
 
 
175 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  62.59 
 
 
155 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  60.14 
 
 
153 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  65 
 
 
150 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  51.08 
 
 
149 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  51.97 
 
 
179 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  54.55 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  50.39 
 
 
175 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  38.97 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.34 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  39.5 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  44.04 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  35.66 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.23 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  43.22 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  39.45 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  32.67 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  41.67 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.4 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  37.84 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  39.82 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.88 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  39.45 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  40.19 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  40.95 
 
 
159 aa  60.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  40.95 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  49.53 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  32.62 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  35.29 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  29.48 
 
 
310 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  41.84 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  31.78 
 
 
310 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  31.78 
 
 
310 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  39.13 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  42.17 
 
 
320 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  39.09 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  40.74 
 
 
319 aa  50.8  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  35.25 
 
 
311 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  36.81 
 
 
311 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  38.46 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  27.75 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  31.47 
 
 
319 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  36.9 
 
 
319 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  37.23 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  30.99 
 
 
312 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  39.33 
 
 
311 aa  48.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.04 
 
 
321 aa  48.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  37.5 
 
 
308 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 
309 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  35.62 
 
 
323 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  36.14 
 
 
346 aa  47.4  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  34.93 
 
 
324 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  34.93 
 
 
324 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  34.69 
 
 
324 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  35.62 
 
 
323 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  38.75 
 
 
320 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  33.76 
 
 
309 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  35.29 
 
 
322 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  41.03 
 
 
315 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  41.67 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  31.03 
 
 
308 aa  46.6  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  35.66 
 
 
319 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  34.94 
 
 
320 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 
340 aa  45.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
314 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  32.7 
 
 
333 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  37.5 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  33.73 
 
 
605 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  36.36 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  32.62 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  38.27 
 
 
309 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  39.24 
 
 
319 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
340 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  33.8 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>