76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7369 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  100 
 
 
150 aa  291  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  70.14 
 
 
180 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  66.67 
 
 
153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  65.03 
 
 
175 aa  180  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  62.94 
 
 
155 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  65 
 
 
168 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  60.56 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  49.32 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  48.98 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  50.38 
 
 
175 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  47.59 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  47.12 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  51.67 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.42 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  45.19 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.19 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  46.61 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  36.23 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.03 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  37.16 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  33.33 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  37.41 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  39.05 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  40 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  40.71 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.61 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  32.9 
 
 
313 aa  60.1  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  42.61 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  37.4 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  41.9 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  40.71 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  40.31 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  32.05 
 
 
309 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  36.59 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  29.09 
 
 
310 aa  55.8  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  32.69 
 
 
310 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  36.19 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  36.52 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  37.41 
 
 
311 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  40.74 
 
 
311 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  41.25 
 
 
319 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  43.75 
 
 
320 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  42.86 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
309 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  41.25 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  38 
 
 
144 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 
311 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  35.77 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  35.77 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.5 
 
 
319 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  36.25 
 
 
321 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  34.96 
 
 
309 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  33.05 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  33.62 
 
 
319 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  28.04 
 
 
308 aa  44.3  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  31.09 
 
 
310 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  35.29 
 
 
330 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
319 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  31.09 
 
 
310 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  31.67 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  33.12 
 
 
324 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  35.63 
 
 
308 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  33.12 
 
 
324 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  33.12 
 
 
323 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  33.12 
 
 
323 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  32.47 
 
 
324 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  28.37 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  34.88 
 
 
312 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>