56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5435 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  100 
 
 		 141 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  57.14 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  59.02 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  57.38 
 
 		 175 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  42.77 
 
 		 186 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  52.99 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  48.7 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  49.14 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  51.67 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  45.53 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  46.96 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  44.83 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  43.97 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  45.61 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  45.53 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  43.22 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  30.6 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.46 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  37.4 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  39.77 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  42.37 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  41.59 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  37.5 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.38 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  41.11 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.8 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  54.55 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  39.29 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  37.3 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  39.09 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  39.39 
 
 		 310 aa  53.9  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  29.55 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  43.75 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  51.52 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  32.06 
 
 		 319 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  38.94 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  32.84 
 
 		 309 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  38.46 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  46.97 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 308 aa  47.4  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  42.02 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  29.63 
 
 		 322 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  28.91 
 
 		 319 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  28.91 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  32.09 
 
 		 311 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  39.39 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  29.63 
 
 		 330 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  42.42 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4645  HPr kinase  38.89 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  30.16 
 
 		 319 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  27.82 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  32.33 
 
 		 311 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  30.15 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.15 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  38.89 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  28.89 
 
 		 331 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>