89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0346 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  330  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  79.29 
 
 
168 aa  255  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  60.26 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  60.56 
 
 
150 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  60.71 
 
 
155 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  58.33 
 
 
153 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  55.97 
 
 
175 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  46.67 
 
 
149 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  46.04 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  46.77 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  44.93 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  39.84 
 
 
142 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.27 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  43.4 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.61 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  32.87 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  36.59 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  36.59 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  42.37 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  39.02 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  43.75 
 
 
148 aa  61.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  30.82 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.38 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  30.43 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  46.22 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  29.87 
 
 
313 aa  58.9  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  35.14 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  33.33 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  37.38 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  39.62 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  42.42 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  34.43 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  35.24 
 
 
159 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  32.14 
 
 
310 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  32.14 
 
 
310 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  32.86 
 
 
310 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  32.43 
 
 
311 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  32.71 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  41.77 
 
 
320 aa  48.5  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  30.43 
 
 
141 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  30.77 
 
 
310 aa  47.8  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  39.08 
 
 
333 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
311 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  35.66 
 
 
319 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  41.25 
 
 
309 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  37.93 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  30.94 
 
 
282 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  25.79 
 
 
308 aa  46.2  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  38.27 
 
 
319 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  36.17 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  31.43 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  36.36 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  35.59 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  30.95 
 
 
310 aa  44.7  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  33.99 
 
 
314 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  31.65 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  36.25 
 
 
346 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  31.34 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  31.37 
 
 
330 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  31.76 
 
 
319 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  31.34 
 
 
309 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 
307 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  28.99 
 
 
307 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  31.65 
 
 
324 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  32.37 
 
 
323 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  31.65 
 
 
324 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  32.37 
 
 
323 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  38.55 
 
 
319 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  37.14 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  37.5 
 
 
320 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  32.09 
 
 
309 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  36.78 
 
 
331 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  34.41 
 
 
321 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  36.47 
 
 
330 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  32.74 
 
 
192 aa  42  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  32.74 
 
 
192 aa  42  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  37.5 
 
 
311 aa  42  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  27.97 
 
 
320 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  35 
 
 
308 aa  41.6  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  28.24 
 
 
305 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  32.1 
 
 
319 aa  40.8  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  34.57 
 
 
340 aa  40.8  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>