142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0613 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  100 
 
 
330 aa  673    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  81.68 
 
 
322 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  79.88 
 
 
331 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  82.5 
 
 
332 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  77.71 
 
 
333 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  77.81 
 
 
340 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  75.08 
 
 
339 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  54.49 
 
 
339 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0153  HPr kinase/phosphorylase  43.66 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.784698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0164  HPr kinase/phosphorylase  43.66 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0146  HPr kinase/phosphorylase  42.7 
 
 
321 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  40.21 
 
 
309 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  39.86 
 
 
309 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  39.48 
 
 
311 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0151  HPr kinase/phosphorylase  40.4 
 
 
321 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  41.87 
 
 
309 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  43.82 
 
 
319 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  40.48 
 
 
319 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2758  HPr kinase  39.85 
 
 
324 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  39.58 
 
 
311 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  38.79 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  41.67 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  39.79 
 
 
311 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  39.29 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  38.38 
 
 
305 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  35.17 
 
 
319 aa  206  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  36.59 
 
 
309 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  37.82 
 
 
308 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  39.03 
 
 
320 aa  203  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  35.9 
 
 
320 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  38.14 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  38.14 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0871  HPr kinase/phosphorylase  44.07 
 
 
316 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3388  HPr kinase/phosphorylase  44.07 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  37.46 
 
 
310 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2969  HPr kinase/phosphorylase  43.82 
 
 
319 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.475153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1885  HPr kinase/phosphorylase  42.96 
 
 
328 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  33.55 
 
 
320 aa  189  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  36.62 
 
 
346 aa  188  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  37.37 
 
 
339 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  33.22 
 
 
330 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  36.49 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  36.49 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
309 aa  182  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1285  HPr kinase/phosphorylase  41.85 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.758729  hitchhiker  0.00000064658 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  30.66 
 
 
310 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  32.21 
 
 
319 aa  169  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  29.41 
 
 
311 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  30.4 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  31.72 
 
 
316 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  31.42 
 
 
316 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  30.46 
 
 
318 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  30.46 
 
 
318 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  34.23 
 
 
319 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  32.43 
 
 
318 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  31.25 
 
 
319 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  29.23 
 
 
318 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  32.39 
 
 
322 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
352 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  33.2 
 
 
323 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  30.64 
 
 
318 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
340 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  31.98 
 
 
322 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  33.2 
 
 
323 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  33.73 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0373  HPr kinase  29.72 
 
 
343 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.254588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  31.46 
 
 
314 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  33.46 
 
 
318 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  32.39 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  32.11 
 
 
316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  32.39 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  32.39 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
312 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  33.59 
 
 
325 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0723  HPr kinase  32.52 
 
 
315 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  30.82 
 
 
313 aa  139  7e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  31.6 
 
 
316 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>