70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0369 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  100 
 
 		 153 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  80.13 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  67.35 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  65.56 
 
 		 180 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  66.67 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  60.14 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  58.33 
 
 		 169 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  53.57 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  51.56 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  48.98 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  48.84 
 
 		 175 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  48.7 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  43.7 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  43.15 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.18 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  40.34 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.06 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  39.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  43.08 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  35.16 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  38.52 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  38.52 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.9 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  39.37 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  38.52 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  33.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  34.92 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  36.11 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.52 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  32.23 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  46.15 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  30.94 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  39.05 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  36.45 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  46.43 
 
 		 320 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  38.1 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  29.29 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  30 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  37.19 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  34.31 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  38.27 
 
 		 319 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  33.73 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  30.94 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  36.59 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  36.9 
 
 		 311 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  39.51 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  39.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  39.51 
 
 		 321 aa  44.3  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  43.28 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  39.29 
 
 		 311 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  37.8 
 
 		 320 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  32.61 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  31.71 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  33.56 
 
 		 319 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  36.9 
 
 		 309 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  34.25 
 
 		 312 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>