63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0595 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  100 
 
 		 180 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  63.22 
 
 		 175 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  70.14 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  60.48 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  65.56 
 
 		 153 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  60.26 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  64.67 
 
 		 155 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  48.59 
 
 		 149 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  47.32 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  55.12 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  51.97 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  50.76 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  49.14 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.28 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.62 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  45.71 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  43.7 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  39.39 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  41.18 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  39.39 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  37.1 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  35.48 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.84 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  41.14 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  40.87 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  39.1 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.41 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  35.42 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  40.57 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  30.88 
 
 		 313 aa  57.8  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  40.38 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  46.46 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  38.1 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  28 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  36.59 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  37.8 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  29.1 
 
 		 319 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  32.09 
 
 		 322 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  36.46 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  42.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  35.82 
 
 		 311 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  38.75 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  34.81 
 
 		 333 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  32.22 
 
 		 308 aa  45.4  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  32.09 
 
 		 331 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  32.56 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  39.51 
 
 		 320 aa  44.7  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  38.14 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0871  HPr kinase/phosphorylase  31.93 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  30.88 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  36.36 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  34.07 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3388  HPr kinase/phosphorylase  31.93 
 
 		 316 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  32.5 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  36.25 
 
 		 308 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  27.93 
 
 		 310 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  27.93 
 
 		 310 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  32.91 
 
 		 605 aa  42  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  37.5 
 
 		 320 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  30.7 
 
 		 310 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  34.12 
 
 		 282 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  28.57 
 
 		 320 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  33.33 
 
 		 330 aa  41.6  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>