167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0400 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  52.27 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  44.78 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.78 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  52.58 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  53.61 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  43.61 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  53.61 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  46.15 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  40.77 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  39.23 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  43.2 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  39.84 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  48.98 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  50 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  42.06 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  38.52 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  42.86 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  43.93 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  52.63 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  44.23 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  46.39 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  38.03 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  32.47 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  32.47 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  47.87 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  38.84 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  38.46 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  36.96 
 
 		 330 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  48.68 
 
 		 339 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  40.21 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  31.91 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  35.8 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  40.38 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  40.21 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  42.11 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  42.11 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  41.76 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  42.86 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  31.5 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  39.42 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  41.56 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  41.09 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  34.07 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  31.82 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  35.53 
 
 		 313 aa  57  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  34.68 
 
 		 311 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  40.91 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  33.82 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  32.37 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  40.74 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  40.26 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  36.11 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  43.02 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  42.86 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  43.27 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  36.09 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  40.4 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  29.32 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  42.25 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  36.76 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  35.94 
 
 		 305 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  35.42 
 
 		 318 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  35.42 
 
 		 318 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  38.64 
 
 		 330 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  35.81 
 
 		 311 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  36.03 
 
 		 316 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  42.68 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  37.69 
 
 		 309 aa  52.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  37.21 
 
 		 331 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  34.72 
 
 		 318 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  39.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  34.85 
 
 		 308 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  36.78 
 
 		 340 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  45.21 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  36.5 
 
 		 318 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  40.96 
 
 		 311 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  34.78 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  39.24 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  34.92 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  35.43 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  44 
 
 		 312 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  36.84 
 
 		 605 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  41.56 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  43.42 
 
 		 282 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  34.65 
 
 		 319 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>