140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0110 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  100 
 
 
318 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  71.71 
 
 
308 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  59.14 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  53.82 
 
 
309 aa  332  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  52.32 
 
 
305 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  48.67 
 
 
309 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  48 
 
 
309 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  48.33 
 
 
309 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  48.33 
 
 
309 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  48.33 
 
 
309 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  48.33 
 
 
309 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  48 
 
 
309 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  48 
 
 
309 aa  291  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  48 
 
 
309 aa  291  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  48 
 
 
309 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  48 
 
 
309 aa  291  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  51.1 
 
 
311 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  50.74 
 
 
311 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  46.58 
 
 
346 aa  278  8e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  46.57 
 
 
319 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  46.83 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  43.67 
 
 
309 aa  268  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  43.33 
 
 
311 aa  265  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  45.79 
 
 
315 aa  262  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  44.67 
 
 
310 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  43.75 
 
 
320 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  44.95 
 
 
307 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  44.95 
 
 
307 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  45.59 
 
 
310 aa  255  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  43.14 
 
 
310 aa  252  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  43.14 
 
 
310 aa  252  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0164  HPr kinase/phosphorylase  43.38 
 
 
321 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0153  HPr kinase/phosphorylase  43.38 
 
 
321 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.784698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0146  HPr kinase/phosphorylase  43.38 
 
 
321 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0151  HPr kinase/phosphorylase  43.01 
 
 
321 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  36.89 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2758  HPr kinase  41.06 
 
 
324 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  43.97 
 
 
319 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  42.35 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  38.66 
 
 
340 aa  225  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3388  HPr kinase/phosphorylase  43.13 
 
 
316 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0871  HPr kinase/phosphorylase  43.13 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1885  HPr kinase/phosphorylase  42.4 
 
 
328 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  39.19 
 
 
339 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  39.42 
 
 
330 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  38.79 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  36.36 
 
 
320 aa  212  9e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2969  HPr kinase/phosphorylase  41.53 
 
 
319 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1285  HPr kinase/phosphorylase  42.5 
 
 
319 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.758729  hitchhiker  0.00000064658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  37.21 
 
 
339 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  37.06 
 
 
332 aa  205  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  36.15 
 
 
333 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  36.67 
 
 
322 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.01 
 
 
321 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  37.27 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  42.08 
 
 
312 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  36.3 
 
 
331 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.38 
 
 
319 aa  195  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  36.49 
 
 
320 aa  192  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  34.64 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  36.72 
 
 
319 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  35.09 
 
 
316 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  35.85 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  35.85 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  34.48 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  34.7 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  36.51 
 
 
318 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  37.45 
 
 
323 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  33.55 
 
 
318 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  35.34 
 
 
311 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  37.45 
 
 
323 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  36.29 
 
 
324 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0723  HPr kinase  35.74 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  36.29 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  36.29 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  31.72 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  31.89 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  35.52 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  37.3 
 
 
314 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  35.14 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0373  HPr kinase  35.98 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.254588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  33.72 
 
 
315 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  34.75 
 
 
328 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>