167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2439 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 		 162 aa  320  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  56.3 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  56.3 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  50.76 
 
 		 142 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  47.83 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  40.6 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  45.79 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  50 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  43.48 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  42.28 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  48.98 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  39.42 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  44.8 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  46.28 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  42.61 
 
 		 325 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  43.69 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  43.69 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  40.8 
 
 		 311 aa  68.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  39.13 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  36.92 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  36.15 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  36.36 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  37.3 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  34.46 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  37.01 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  44.54 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  35.25 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  35.61 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  37.4 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  36.15 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  36.15 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  44.63 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  39.34 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  39.23 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  40.46 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  36.15 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  37.9 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  38.46 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  43.62 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  32.84 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  34.92 
 
 		 319 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  35.2 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  37.82 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  41.89 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  36.43 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  39.84 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  33.33 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  42.71 
 
 		 311 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  38.26 
 
 		 315 aa  60.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  38.93 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  41.38 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  37.6 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  45.33 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  36.07 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  39.13 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  37.01 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  31.2 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  39.47 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  46.58 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  46.58 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  42.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  37.01 
 
 		 328 aa  57.4  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  45.33 
 
 		 316 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  47.76 
 
 		 310 aa  57.4  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  35.11 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  25.98 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  37.27 
 
 		 323 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  41.25 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  33.86 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  41.25 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  39.2 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  43.59 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>