100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2847 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  100 
 
 
149 aa  283  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  54.11 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  53.57 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  51.39 
 
 
155 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  49.32 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  51.08 
 
 
168 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  48.59 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  46.67 
 
 
169 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  56.19 
 
 
175 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  48.44 
 
 
179 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  48.7 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  47.96 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  41.84 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  44.88 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  44.83 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  42.71 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  46.23 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  45.28 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  47.12 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.69 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  45.28 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  38.93 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  42.2 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  41.67 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  43.24 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  43.4 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  37.6 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  43.12 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  35.9 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  35.83 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  39.76 
 
 
313 aa  57  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  45 
 
 
309 aa  57  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  34.48 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  38.14 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.27 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  39.58 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  41.94 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.71 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  40.48 
 
 
319 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  40.48 
 
 
311 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  44.16 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  39.8 
 
 
320 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  36.36 
 
 
310 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  43.04 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
308 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  43.04 
 
 
319 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  39.24 
 
 
321 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  47.62 
 
 
311 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
310 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  39.29 
 
 
310 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
310 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
310 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  37.65 
 
 
605 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  38.75 
 
 
319 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  36.9 
 
 
340 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  43.37 
 
 
309 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  43.37 
 
 
309 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  36.9 
 
 
307 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  36.9 
 
 
307 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  41.25 
 
 
311 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  35.71 
 
 
339 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  32.46 
 
 
312 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  42.17 
 
 
309 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  35.29 
 
 
322 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  36.84 
 
 
316 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  36.84 
 
 
316 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  36.9 
 
 
310 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  36.71 
 
 
339 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  38.55 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  36.9 
 
 
310 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  37.65 
 
 
330 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  36.47 
 
 
333 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  37.66 
 
 
339 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  37.97 
 
 
305 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  38.75 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  35 
 
 
319 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  36.47 
 
 
331 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
315 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  39.24 
 
 
316 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  37.5 
 
 
308 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  37.5 
 
 
314 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  38.75 
 
 
318 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  39.74 
 
 
316 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  42.5 
 
 
308 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  33.71 
 
 
346 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  35.38 
 
 
364 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  38.75 
 
 
316 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  32 
 
 
309 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  30.38 
 
 
320 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>