135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1002 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  100 
 
 
318 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  89.21 
 
 
318 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  89.21 
 
 
318 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  87.97 
 
 
318 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  86.39 
 
 
318 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  82.59 
 
 
316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  84.35 
 
 
316 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  81.33 
 
 
316 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  78.73 
 
 
319 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  73.42 
 
 
318 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  69.97 
 
 
325 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
340 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  57.73 
 
 
322 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
352 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  58.04 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  58.47 
 
 
322 aa  362  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  57.73 
 
 
322 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  57.41 
 
 
322 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  55.81 
 
 
328 aa  352  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  56.87 
 
 
324 aa  350  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  56.87 
 
 
323 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  57.19 
 
 
323 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  55.66 
 
 
328 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  56.87 
 
 
324 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  56.87 
 
 
324 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  50.16 
 
 
315 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  52.94 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  47.77 
 
 
314 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  42.72 
 
 
319 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  40.58 
 
 
316 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  40.58 
 
 
316 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  41.35 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  40.58 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  41.21 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0723  HPr kinase  38.98 
 
 
315 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  36.23 
 
 
310 aa  189  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 
311 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.33 
 
 
310 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  37.33 
 
 
310 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  34.71 
 
 
311 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  33.01 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  36.7 
 
 
319 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2758  HPr kinase  33.77 
 
 
324 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  37.22 
 
 
309 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  32.68 
 
 
309 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  32.69 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  37.22 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  35.27 
 
 
311 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  31.86 
 
 
310 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  31.86 
 
 
310 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0164  HPr kinase/phosphorylase  32.14 
 
 
321 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0153  HPr kinase/phosphorylase  32.14 
 
 
321 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.784698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  32.77 
 
 
320 aa  176  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0146  HPr kinase/phosphorylase  32.14 
 
 
321 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  31.62 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  34.48 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0373  HPr kinase  34.63 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.254588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0151  HPr kinase/phosphorylase  31.07 
 
 
321 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131882 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  30.84 
 
 
321 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  33.21 
 
 
319 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  38.02 
 
 
315 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  34.1 
 
 
330 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  35.44 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  35.44 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  28.9 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  33.81 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  35.18 
 
 
331 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  35.47 
 
 
339 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  31.76 
 
 
340 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  32.73 
 
 
333 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  34.78 
 
 
322 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  31.16 
 
 
319 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  31.18 
 
 
305 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  33.33 
 
 
320 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  29.23 
 
 
330 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  31.95 
 
 
309 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  34.39 
 
 
339 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1885  HPr kinase/phosphorylase  34.31 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  33.21 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3388  HPr kinase/phosphorylase  32.96 
 
 
316 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>