150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0113 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  100 
 
 		 158 aa  300  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.93 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  45 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  45.16 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  45.11 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  41.73 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.54 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  41.45 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  41.14 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  45.37 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  45.53 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  43.79 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.44 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  41.67 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  43.08 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  46.22 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  49.53 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  43.59 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  40.46 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.42 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  38.35 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  39.5 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  43.51 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  38.85 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  38.64 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  37.61 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  40.17 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  36.3 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  45.31 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  42.52 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  39.66 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  44.12 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  42.02 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 311 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  41.46 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  42.86 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  36.03 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  35.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  40.62 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  38.16 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  39.05 
 
 		 311 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  36.84 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  40.62 
 
 		 328 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  37.5 
 
 		 323 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  38.16 
 
 		 324 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  38.16 
 
 		 324 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  41.58 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  35.11 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  30.66 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  35.29 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  35.29 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  37.59 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  28 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  28 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  31.3 
 
 		 308 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  37.88 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  35.29 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.14 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  31.14 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  27.19 
 
 		 308 aa  52.8  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  30.15 
 
 		 308 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  37.5 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 		 307 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  36.59 
 
 		 307 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.18 
 
 		 319 aa  52.4  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  32.59 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  37.72 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  35.24 
 
 		 309 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  34.59 
 
 		 339 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  35.88 
 
 		 318 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  36.51 
 
 		 318 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>